有机肥的使用越来越多，土壤种植时，施入有机肥能起到改善土壤，增加有机质的作用。蚯蚓粪、秸秆、牛粪、菌棒等，也可以作为无土栽培的基质，不仅价格低廉，而且效果也不错。但是在使用过程中粪肥烧根、烧苗的问题也很多，给农户造成损失。
比如有农户用秸秆、牛粪作为基质种植黄瓜，定植后发现大部分幼苗都死了，还有一些幼苗不长根。还有一些农户在大棚里使用鸡粪、羊粪，也存在死苗不生根的情况，尤其在夏秋季节高温时期常出现。出现这些情况，主要是因为粪肥没有发酵或者发酵不充分造成的，并不是这些有机肥不能使用。粪肥在使用时，一定要注意两个方面。
1、粪肥在使用之前要先充分腐熟，即使粪便晒干或者自然发酵后栽苗，也存在一定的风险，最好加上发酵剂进行腐熟。发酵剂中含有多种复合菌类，利于秸秆粪便充分腐熟。不仅能提高发酵速度，而且还能杀灭病虫、草籽，腐熟更充分，更有利于蔬菜的生长，避免定植后出现烧苗。
将原料加水和发酵剂拌匀，然后堆在一起，上部盖上一层塑料袋，四周不用盖严。在升温后，翻一次和空气接触。等到没有臭味，体积变小，这也是发酵完成的标志。或者将发酵剂和红糖拌匀，然后再倒入原料中进行发酵，腐熟的效果会更好。无土栽培制作基质，农户也用这个方法处理。
2、如果大棚内施入没有完全腐熟的有机肥，蔬菜定植后出现肥害，最明显的症状就是烧根黄叶，趁早发现，还有缓解的机会。肥害发生初期，就要准备补救，促使根系重新发根，降低死苗的损失。
比如用生根剂进行冲施，强制生根。然后再使用海藻精，促进长出新根，调节地上部分生长，提高抗逆性。蔬菜出现黄叶，通过叶面喷施碧护加上叶面肥，促进叶片生长，同时再次促进生根。
现在无土栽培瓜果蔬菜，很多农户朋友使用有机基质，来降低种植成本。比如使用牛粪作为栽培基质，成本很低。但是对于新手来说，牛粪直接栽苗就会出现问题，需要充分发酵之后再使用。出现肥害后，要采取补救措施。所以，无论是作为有机肥还是栽培基质，秸秆粪便在使用前都要进行充分腐熟。
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